Jego kamera towarzyszyła ekshumacjom polskich oficerów w Charkowie i Miednoje zamordowanych przez NKWD. Przez 40 dni skrupulatnie filmował poszczególne etapy działań prokuratorów, archeologów, kryminologów. Dziś te dokumenty zapisane na 7 tys. metrów taśmy filmowej, złożone w archiwum Chełmska są jednym z najważniejszych świadectw tego mordu dokonanego na polskich oficerach. Wynikiem wyprawy był też pełnometrażowy dokument „Nie zabijaj”, zbudowany wokół zeznań dwóch katów odpowiedzialnych za podpisanie dokumentów o likwidacji polskich oficerów. Film uzupełniają nagrania z poszukiwania grobów, wydobycia szczątków zamordowanych oficerów.
Do tematyki katyńskiej Gębski wrócił w 2007 r. realizując pełnometrażowy dokument „Katyń”. Wykorzystał w nim nieznane dotąd rosyjskie kroniki, wypowiedzi amerykańskiego profesora Roberta Conqesta. Zauważył zbieżność polityki Hitlera i Stalina w eksterminacji polskiej inteligencji. Zastanawiał się też nad przyczynami przemilczania przez Zachód kwestii katyńskiej. Kolejny film „Pan Ksiądz” to zapis jednej z ostatnich rozmów ze zmarłym w 2007 r. ks. Zdzisławem Peszkowskim, który jako jeden z nielicznych jeńców przebywających w obozie w Kozielsku nie został rozstrzelany. Kielecki wątek katyński zawarł w dokumencie pt. „Film znaleziony w Katyniu”. Kanwą tego opowiadania były zapiski znalezione przy policjancie w grobie katyńskim.
W 2009 roku obchodzono w Kielcach uroczyście jubileusz 40-lecia pracy twórczej i 70-lecia urodzin Józefa Gębskiego. Z tej okazji zorganizowano pokazy jego filmów, dyskusje oraz benefis.
Źródło:UJK, OMPiO, www.filmpolski.pl