Wszystkie woluminy poddano dezynfekcji i dezynsekcji, a następnie mechanicznemu oczyszczaniu karta po karcie. Wybrane rękopisy zdigitalizowano oraz udostępniono w Cyfrowej Bibliotece Diecezjalnej. Odkażone zbiory umieszczono w opakowaniach bioochronnych. Wśród zdigitalizowanych rękopisów znalazły się m.in. kancjonały benedyktynek sandomierskich, skrypty z filozofii i retoryki, dokumenty wizytacji biskupich, archiwalia klasztorne, księgi miejskie i XV wieczne rękopisy kazań.